Cuando estalló la persecución de Shinyu en 1801, Pedro Kim se refugió junto con Andrés Kim llevando solo libros sagrados y objetos religiosos, viviendo en el monte Museongsan de Gongju dedicados a practicar la fe. Sin embargo, fueron descubiertos rápidamente. Pedro fue llevado a Hongju y Andrés a Yesan. Durante el traslado, ambos irradiaban alegría divina. Al separarse, dijeron: “Mañana al mediodía, nos veremos de nuevo en el cielo.” Pedro fue encarcelado en Daeheung y, el 25 de agosto de 1801, entregó su vida por la espada ante la población.