Nel febbraio del 1827 la Persecuzione Jeonghae, iniziata nella zona di Gokseong devastò completamente le comunità cattoliche. I fedeli della regione di Jeolla si rifugiarrono nella parte occidentale della provincia di Gyeongsangnam-do. Questa zona protetta dalle montagne Jirisan e Deogyusan era molto isolata e quasi nessuno vi transitava per questo i credenti che vi si nascondevano non attiravano l’attenzione.

Durante il rigido inverno del 1827 e la successiva siccità estiva, molti cattolici che vivevano nascosti sulle pendici del Deogyusan morirono di freddo o di fame. Con l’arrivo della primavera, i sopravvissuti si dispersero cercando rifugio presso le case dei villaggi vicini, e molti proseguirono verso sud, nelle zone di Masan e Busan.

Intorno al 1860, in tutta la Corea esistevano 153 villaggi cattolici di cui otto nella regione di Masan. Nel 1861 entrò segretamente in Corea Padre Félix-Clair Ridel che, come successore di Padre Tommaso Choe Yang-eop, ricevette l’incarico di evangelizzare la provincia di Gyeongsang. Nel 1869 sarebbe diventato il sesto Vicario Apostolico di Corea.

Questi villaggi tuttavia, furono quasi completamente distrutti durante la Persecuzione Byung-in del 1866 e la Persecuzione Mujin del 1868.

Nella regione di Gyeongsang si ricominciò la missione grazie a Padre Achilleo Robert, che entrò in Corea nel 1877, a soli 24 anni, e si dedicò alla predicazione nelle zone montuose, vivendo nascosto tra villaggi remoti. Nel 1886 fu incaricato della zona di Waegwan e nel 1887 si recò persino a Okpo nell’isola di Geoje per amministrare il Battesimo ai familiari del martire Yoon Bong-mun.

Il 9 giugno 1897 Padre Lorenzo Kang Seong-sam, terzo sacerdote coreano fu nominato viceparroco della prima chiesa diocesana di Masan, il Santuario di Myeongnae. Ordinato a Seoul il 26 aprile 1897 da Mons. Mutel portò nuovo fervore alla parrocchia.

Essendo di salute fragile, morì prematuramente il 19 settembre 1903, all’età di 38 anni, dopo soli sei anni di ministero. Nel 1916 la comunità poté finalmente costruire l’edificio dell’attuale Chiesa di Myeongnae ottenendo il riconoscimento ufficiale della diocesi.

Quando le cappelle e le comunità della regione di Gyeongsang meridionale si espansero, si avvertì la necessità di un nuovo centro parrocchiale. La prima località scelta fu Jinju. Il 21 luglio 1898, i fedeli presentarono una petizione chiedendo l’invio di un sacerdote.

Venutone a conoscenza Padre Émile Taquet, parroco di Busan, sostenne fortemente l’idea della nuova parrocchia e si offrì volontario come primo sacerdote. Giunto a Jinju il giorno precedente la Pentecoste del 1899, comprò due case: una venne adattata a chiesa e l’altra a casa parrocchiale. All’inizio fu accolto con entusiasmo dai fedeli e dagli abitanti, che vedevano in lui la speranza di essere difesi dagli abusi dell’amministrazione locale. Tuttavia, alcuni funzionari e teppisti della zona gli si opposero e lo perseguitarono apertamente. A causa di queste difficoltà, Padre Taquet decise di trasferire la sede parrocchiale. Inizialmente pensò alla cappella di Sochon (oggi Parrocchia di Munsan), ma alla fine scelse Masan, dove nel 1900 fu fondata la Chiesa di Wanwoldong. La cappella di Sogok a Jinju divenne nel 1905 la Parrocchia di Munsan.

La regione di Masan, che era sotto la giurisdizione dell’Arcidiocesi di Daegu, venne separata nel 1966. Il 15 febbraio 1966, Papa Paolo VI eresse canonicamente la Diocesi di Masan separandola dalla Diocesi di Busan. Oggi la diocesi comprende 74 parrocchie.

Nel 2025, il sesto vescovo diocesano, Mons. Lino Lee Seong-hyo, è stato nominato alla guida della diocesi.