La fe católica llegó a la región de Cheongju antes de la persecución Shinyu de 1801, pero la mayoría de los fieles vivieron ocultos para evitar las persecuciones y mantuvieron su fe en secreto. Por ello, cuando a partir de 1882 se permitió cierta libertad para la evangelización, surgieron rápidamente varias capillas y la comunidad católica creció día tras día. En 1896, el padre Bouillon construyó una iglesia en Gammok, y así nació la primera parroquia oficial de la región. Posteriormente, en 1906 se fundó la segunda parroquia en Okcheon, seguida de Cheongju, Jeungpyeong, Jecheon y Gyohyeon, para un total de seis parroquias. Entre ellas, la parroquia de Jeungpyeong fue cerrada durante la Guerra de Corea, y finalmente solo cinco parroquias fueron confiadas en 1953 a la Sociedad para las Misiones Extranjeras de Maryknoll como vicariato de la provincia de Chungcheongbuk-do.

El vicariato de Chungcheongbuk-do se convirtió en territorio independiente como Vicariato Apostólico de Cheongju el 23 de junio de 1958, y el padre James Pardy fue nombrado por la Santa Sede primer vicario apostólico el 4 de julio del mismo año. Su consagración episcopal tuvo lugar el 16 de septiembre en los Estados Unidos, y la ceremonia de toma de posesión se celebró el 26 de noviembre. Posteriormente, en 1962, con el establecimiento del sistema jerárquico en la Iglesia coreana, el Vicariato de Cheongju fue elevado a diócesis.

Los últimos cincuenta años han sido un periodo de grandes cambios para la diócesis de Cheongju. A finales de los años cincuenta, la sociedad coreana se encontraba en una situación de pobreza económica y confusión política, pero gracias al celo misionero de los sacerdotes de Maryknoll y a la espiritualidad de fe de los católicos locales, la diócesis pudo sentar las bases para la evangelización de la región.

Cuando fue fundada en 1958, la diócesis contaba con 15 parroquias, unos veintiún mil fieles y 25 sacerdotes de Maryknoll. A finales de mayo de 2016, la diócesis había crecido notablemente hasta contar con 76 parroquias (incluidas 2 cuasiparroquias), unos 163.000 fieles, 183 sacerdotes, escuelas de nivel medio y superior, centros educativos especiales, un gran hospital y más de sesenta instituciones de asistencia social.

Con el sínodo diocesano, la diócesis da un paso firme hacia un nuevo periodo de cincuenta años, es decir, hacia el camino del centenario. Como primer hito de esta trayectoria, se compartió la Visión 2050 con la mirada puesta en el año 2020. La Visión 2050 consiste en cumplir plenamente la misión propia de la Iglesia para alcanzar una comunidad de doscientos mil fieles y cien parroquias. No significa simplemente un crecimiento numérico, sino que representa una invitación a la renovación de la diócesis, al progreso espiritual y al compromiso de desempeñar el papel de luz y sal en la sociedad y en el mundo.