Fino al momento del martirio, Pietro Son svolse con fedeltà il suo incarico di capo della comunità dei fedeli. Durante un interrogatorio, la sua identità fu scoperta e le autorità gli imposero di rivelare i nomi dei missionari stranieri che avevano visitato la comunità e la provenienza dei libri religiosi. Subì allora torture e punizioni terribili, ma, nonostante i dolori atroci, continuò a incoraggiare e confortare i compagni di prigionia. Alla fine, nel luogo di Supjeongi pronunciando i nomi di Gesù e Maria, fu decapitato a quarantasette anni, offrendo la propria vita per la fede.

Quando le guardie attaccarono il villaggio cattolico di Seongji-dong, egli rifiutò di fuggire, nonostante la malattia, e fu arrestato e condotto al quartier generale di Jeonju. Il governatore, credendo che un malato come lui avrebbe facilmente abiurato, lo interrogò per primo, infliggendogli crudeli torture e sofferenze, ma Lee Myeong-seo rifiutò di rinnegare la fede. Pregando con fervore insieme ai compagni catturati, si preparò al martirio e morì a Supjeongi all’età di 46 anni.